相马家在关原的立场简单说就是中立。
1590左右，因受到政宗执拗的猛攻，其实相马氏已如风中残烛。主战派的义胤最终说明主降派隐居的盛胤，决定顽抗到底，妙见社遗留的再兴请原文上记载当时相马氏，加上自愿参战的乡人，总兵力一共只有可怜480名。
本来很快就应该是灭亡命运的相马氏，出现了一个奇迹般的转机，那就是秀吉的小田原征讨。政宗和义胤都被强制要求参阵。政宗因为处理内部的问题（即因亲母下毒，乘机斩杀亲弟小次郎事件）而迟到，虽然最终被宽恕，但是从芦名氏夺来的旧领会津、岩濑、安积等郡被没收。另一方义胤虽然也参阵迟到，但因为石田三成的周旋而不问罪。战后获近江蒲生500石。
加上大崎、葛西、石川、结城、田村等一干不参阵大名都被改易，给奥州留下了旷阔的空间。且文禄之役时，义胤虽然身染重病还是坚持到肥前名护屋城参阵，受到了秀吉的赞赏。1593年“文禄检地”时，相马义胤又成为坐拥宇多、行方、标叶三郡的大名。
1598年秀吉死去。1600年关原之战爆发。义胤因为在小田原及朝鲜战争中和三成结下的深厚友谊（义胤之子孙次郎就受三成一字而称三胤，即之后的利胤）而和佐竹义宣、岩城贞隆一起选择了中立。东北战争中也几乎没有参战。
战后，和三成亲近的佐竹义宣被改易。相马、岩城2氏作为佐竹的与力也被改易。义宣同意如果相马愿去秋田就分1万石给相马。
但相马义胤认为如果去了秋田就等于灭亡了，其子三胤（当时因忌讳三成已改为蜜胤）勇敢的上京，之前出奔到上衫家的重臣泉胤政也为了旧主的再兴而奔走，通过本多正信的中介终于取得了家康的原谅。相马氏保留了旧领三郡而再兴。
蜜胤就此留居江户，不久通过土井利胜的中介，迎娶秀忠的养女（之后的长松院）为妻。蜜胤也拜领了利胜的一字改为利胤。从此相马家安泰。
PS：
一直有一种说法是由于伊达政宗的奔走，相马家才再兴的。而政宗之所以愿意帮宿敌相马是因为1600年关原之战中有一次政宗只带了很少的兵马路过相马领归国，相马家臣建议乘机偷袭，但是义胤说：“虽是宿敌，但是在趁人之危非武士之作为。”所以之后政宗感那次的恩德而在相马家改易后奔走相助。
其实这个故事大概是虚构的，因为该典故的来源是伊达家出《藩翰谱》。其实当时政宗是极力反对相马家的再兴的，从他给重臣鬼庭纲元的书信中可以看出。而相马家真正值得家康原谅的是在关原中，其实相马家也曾迫于家康的压力而夜袭过上衫家的城池，那场战役叫“月夜田之战”。家康之所以同意相马家再兴，除此之外，大概就是也想利用相马对政宗也起着一定的牵制作用罢。
