围棋由中国隋朝传入日本，当时日本正处于奈良时代。最早的棋谱是由日莲上人对吉祥丸的一局棋。
　　到了战国时代，围棋流行与各国大名中间，武田信玄就是一例，因为围棋多多少少与野战和守城有一定关系，其常与部下高阪昌信对弈，昌信的棋艺略高一筹。这也可证明当时的围棋氛围。
　　战国中最著名的棋局莫过于1582年在本能寺中日海（初代本因坊算砂）与鹿盒利贤在织田信长面前下的一局棋，传说下出了罕见的“三劫”，而后就发生了本能寺之变，其实那局棋并没走出什么三劫，而是日海轻松获胜，他侍奉信长，秀吉，家康三代，是当时第一高手，但那以后“三劫”就被视为不吉利的预兆。
　　围棋的真正兴盛时期是在江户时代，当时的本因坊道策开创了新的布局，使围棋技术有了很大的飞跃，被世人称为棋圣，其后的本因坊秀策又把围棋带到了新的高度，他曾在“御城棋战”中连续十三年不败，连胜19局，可惜英才早逝，于34岁因霍乱去世。
　　江户末年，围棋进入了一个停滞的时期，明治时期更是无所建树，直到1933年（昭和8年）才出现新的布局，首战是木谷实对长谷川章，这对现在有着重大影响，使日本围棋发展到今天。

本能寺三劫之变的传说

　　1582年6月1日晚，在京都本能寺，织田信长酒足饭饱。便召来了鹿盒利玄和日海两位僧人在他的面前下棋作娱。
　　日海是信长的围棋师父，但信长仍直呼其名。在对弈过程中，日海说：“主公虽已位高权重，但难免因此招来怨恨。”
　　“本公一生杀人无数，结怨于天下，世人皆怨恨本公，我也不怕。”信长满不在乎的说。
　　“但身边的仇家往往比敌人更可怕。”
　　“是吗？”
　　“主公还记得您当众羞辱别人，扯着他的头发不放戏弄他吗？”
　　“不记得！”
　　“主公还记得别人至爱的母亲，因为主公的缘故而死吗？”
　　“不记得！”
　　“那主公还记得有人棋艺高强，但偏偏要被迫输给主公吗？”
　　“光秀吗？”信长这时才想起来，“日海，那说起来全是你的功劳啊，是因为你的提示本公才赢了棋的。”
　　“当我举棋不定，快下错的时候，日海你就合一下扇子，就这样啪的一声响，我就知道自己走错了。”
　　“当光秀知道我们作弊时，已经来不及了，哈哈！”
　　日海莫不做声，继续与利玄下着棋，黑子与白子交替增多，棋盘上的棋子渐渐集中到了一边，双方展开了激烈的对杀，日海提了一个子，利玄也提一个子，局面成焦灼状态，这时，日海把手缩了回去，眼睛盯着棋盘，陷入了沉思。
　　信长看了看棋盘，说：“有两个劫了吗？”（劫，围棋术语，即一方提了子，对手不能马上提回，必须下一回合才能再提回，这是为了避免对弈时发生反复提子的尴尬局面而特殊设定的规则，那个提子点就被称为劫，有难解难分之意，反复提劫的过程被称为打劫。）
　　“不，看上去是两个劫，但我已不能退缩了。”随即又提了一个子，利玄也提了一个子。
　　这时，棋盘上形成了一个很奇怪的棋形，棋子在一边形成了三个连续的劫，日海此时也很吃惊眼前的局面，在棋盒里的手又缩了回来。喃喃说：“三劫，三劫，在下也是第一次看到啊。”
　　“哈哈哈！这是吉兆，吉兆啊！十分罕见的棋局出现在眼前就是吉兆！日海，本公已说是吉兆，别再愁眉不展了！”
　　但日海仍紧锁眉头，低语道：“今晚月亮没有升起，三劫无进无退，代表没有胜负，这局就到此吧。”说着伸手要收拾棋盘。
　　信长把手一摇：“不可，难得一见的棋局，就让它这样摆着吧。”
　　日海沉默了一会儿，起身道：“夜深了，在下也该告退了，那边宴席也结束了，请主公早点休息吧。”说完便带着利玄走了出去。
　　“日海！”信长叫住他，“现在你与本公下棋让我五子，那你和光秀下棋，你让他几子？”
　　“大约四子吧。“
　　“那好，下次你和本公下也让四子吧。”说完冲日海一笑。
　　“如果您愿意，日海随时奉陪。”
　　日海与利玄走出前厅，利玄问：“大师，今天其实时辰还早，为何走得如此匆忙？”
　　“我早就想走了，今天我感觉黑色的寒意在不断扩散，还是尽早离去吧……”
　　于是两人匆匆离开了本能寺。

　　本能寺内，信长心里总在想：三劫，三劫。又看了看棋盘，起身去睡觉了。
　　半夜，喧杂的噪音响破云霄，信长从睡梦中惊醒，叫道：“阿兰！阿兰！怎么回事！”
　　森兰丸从外面跑了出来，大叫：“主公！主公！外面有人造反！”
　　“旗帜为何？”
　　“紫色橘梗花纹的……”
　　“光秀吗？”信长的脸上显出了阴影。
　　“拿弓箭来！”
　　………………
　　………………
　　然后的事大家都知道，信长看了看棋局，“三劫……”，然后这个一代君主跳入了火海。

　　明智光秀冲进了本能寺，四处寻找信长，他的怒火就象本能寺的火一样熊熊燃烧。
　　他看到了前厅的棋局，仔细一看，棋盘上的三劫赫然映入眼帘，“三劫？这一定是不祥之兆……难道？”
　　“明智大人！大人！”从里面跑来一个军士。
　　“怎么了？”
　　“到处是火，找不到信长公的尸首……”
　　“什么！？找不到？可恶！！”
　　光秀又看了一眼棋局，“难道说今天看到了这三劫的棋局，就预示着得不到信长的头吗！”光秀恼羞成怒。
　　光秀心中阴云密布，长叹道：“这就是命运吗？我真的不能报仇吗？难道我真的不能取得天下吗！？”而后果然光秀被秀吉所灭。

　　民间流传的故事也未可信，日海与利玄的棋局也没有下出三劫，下出三劫的棋局仿佛是另一局，但经移花接木就变成了今天的故事，从那以后，三劫就使人想到厄运，想到不幸预示着灾难。

*人物介绍
　　日海 寂光寺僧人 第一期本因坊（古代日本的一个围棋派别，后来成为一种头衔，今天仍有本因坊的赛事），被称为本因坊算砂，可以说是战国围棋的第一高手。
　　鹿盒利玄（第二个字并不是盒，字表里找不到，权用字形相近的“盒”来代替），本能寺僧人,是林派（日本古代围棋的一个派别）的始祖。